分体式水冷系统比其他水冷系统复杂，安装和维护都更加困难，热量传递效率没有其他水冷系统高，价格也比其他水冷系统要高，而且容易受到外界环境的影响，所以不推荐使用。

分体式水冷散热器的散热效果通常比一体式水冷散热器更好，因为水冷排可以安装更多的散热片，从而提高散热面积和散热效率。分体式水冷散热器还通常比较耐用，因为可以根据需要更换散热排、冷头等零件。